Cercetătorii spanioli au dezvoltat un instrument care poate identifica mutațiile tumorilor

Un instrument de calcul care identifică mutațiile factorilor de cancer pentru fiecare tip de tumoră a fost dezvoltat recent de o echipă de cercetători de la Institutul de Cercetare în Biomedicină din Barcelona. Descoperirea poate contribui la accelerarea cercetării cancerului și ar putea oferi instrumente pentru a ajuta oncologii să aleagă cel mai bun tratament pentru fiecare pacient.
Fiecare tumoare, în mod individual, acumulează multiple mutații, însă nu toate sunt relevante pentru dezvoltarea cancerului. Cercetătorii Institutului de Cercetare în Biomedicină din Barcelona, conduși de Núria López-Bigas, au dezvoltat un instrument bazat pe metode de învățare automată, denumit BoostDM, care evaluează contribuția potențială a tuturor mutațiilor posibile ale unei gene într-un tip dat de tumoare la dezvoltarea și progresia cancerului.

În lucrările anterioare, deja disponibile comunității științifice și medicale, laboratorul a dezvoltat o metodă pentru a identifica genele responsabile de apariția, progresia și răspândirea cancerului. „BoostDM merge mai departe: simulează fiecare posibilă mutație din cadrul fiecărei gene pentru un anumit tip de cancer și indică care sunt cheia procesului cancerului. Aceste informații ne ajută să înțelegem cum este cauzată o tumoare la nivel molecular și poate facilita tratamentul medical”, explică dr. López-Bigas, șeful laboratorului de genomică biomedicală. În plus, instrumentul va contribui la o mai bună înțelegere a proceselor inițiale de dezvoltare a tumorii în diferite țesuturi.

BoostDM lucrează în prezent cu profilurile mutaționale a 28.000 de genomi analizați din peste 60 de tipuri de cancer. Domeniul de aplicare al BoostDM va crește ca urmare a creșterii previzibile a genomurilor cancerului accesibile publicului. Instrumentul pe care cercetătorii l-au dezvoltat a generat deja 185 de modele pentru a identifica mutațiile unei gene specifice într-un anumit tip de cancer. Pe măsură ce datele secvențiale despre tumori devin accesibile publicului, acestea pot fi încorporate în sistem, permițându-i să genereze noi modele pentru toate genele cancerului în următorii ani.

sursa: Science Daily