Cercetătorii îmbunătățesc căutarea genelor care conduc la apariția cancerului

O echipă de cercetători de la Washington State University, condusă de Assefaw Gebremedhin din cadrul WSU School of Electrical Engineering and Computer Science, a dezvoltat un model de rețea computerizat, numit DiWANN, pentru a identifica mutații genetice care colaborează pentru a stimula progresia cancerului. Acest model, raportat în jurnalul Frontiers in Bioinformatics, permite analiza eficientă a unor volume mari de date genetice ale cancerului, identificând mutații care apar împreună și alte similitudini între elementele secvenței ADN pentru diferite tipuri de cancer.
Cercetarea a relevat că anumite tipuri de cancer prezintă mutații foarte omogene, care apar constant, în timp ce alte tipuri manifestă o varietate mare de mutații, ceea ce le face mai greu de tratat. De exemplu, cercetătorii au descoperit că două mutații specifice în cancerul pancreatic tind să apară împreună, una suprimând creșterea tumorii, iar cealaltă stimulând proliferarea.

Modelul DiWANN este mai eficient și mai puțin complex decât modelele anterioare, fără a pierde componente structurale esențiale. Acesta permite reprezentarea minimală a rețelelor, accelerând computația și scalarea analizei. Această abordare a fost utilizată anterior și în studiul distribuției bolilor transmise de căpușe și în analiza răspândirii COVID-19.

Prin adăugarea unei etape de reducere a datelor și a unui al doilea model computerizat, cercetătorii au reușit să reducă și mai mult necesarul de calcul și să obțină noi înțelegeri despre genele care co-ocur. Aceste descoperiri deschid calea spre dezvoltarea unor tratamente comune pentru tipurile de cancer strâns legate între ele.

În prezent, echipa lucrează la dezvoltarea unui instrument bazat pe web pentru experții în sănătate publică, facilitând utilizarea acestui model în studiul întrebărilor complexe legate de cancer și alte boli. Studiul a fost sprijinit de National Science Foundation și National Cancer Institute.

sursa: Science Daily